MOLECULAR ANALYSIS OF NSP4 CODING GENE OF PORCINE ROTAVIRUS IN BRAZIL

Autores

  • M. S. CUNHA Instituto Biológico de São Paulo.
  • P. E. BRANDÃO Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS. Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.
  • M. K. NISHIDA Instituto Biológico de São Paulo. Pós-graduação em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio. Área: Saúde Animal
  • V. L. A. RUIZ Depto. de Medicina Veterinária Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos Universidade de São Paulo - Campus de Pirassununga
  • F. GREGORI Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS. Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.

DOI:

https://doi.org/10.15361/2175-0106.2015v31n1p42-49

Resumo

The non-structural protein 4 (NSP4) has different roles in rotaviral replication, morphogenesis, and enterotoxin-like activity causing secretory diarrhea. A total of 11 partial nucleotide sequences of NSP4 coding gene were defined from group A rotavirus circulating in Brazilian swine herds. On comparing the viral sequences of diarrheagenic peptide area (amino acid 114-135), there was a single point mutation at amino acid 135 presented by two strains with amino acid alanine, and valine in the others. The NSP4 gene phylogeny showed that all strains clustered into E1 genotype, and the nucleotide identity between Brazilian strains ranged from 92.4% and 100%, while the putative amino acid identity, between 95.8% and 100%. Only one site (138aa) was positively selected and at least 119 were negatively selected. As a conclusion, these data demonstrate the occurrence of a common NSP4 genotype described elsewhere in pigs and low diversity between the samples from the surveyed areas.

Biografia do Autor

M. S. CUNHA, Instituto Biológico de São Paulo.

Instituto Biológico de São Paulo.

Pós-graduação em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio.

Área: Saúde Animal

P. E. BRANDÃO, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS. Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.

Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS.
Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas.
Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.

M. K. NISHIDA, Instituto Biológico de São Paulo. Pós-graduação em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio. Área: Saúde Animal

Instituto Biológico de São Paulo.

Pós-graduação em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio.

Área: Saúde Animal

V. L. A. RUIZ, Depto. de Medicina Veterinária Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos Universidade de São Paulo - Campus de Pirassununga

Depto. de Medicina Veterinária
Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos
Universidade de São Paulo - Campus de Pirassununga

Área: Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal

F. GREGORI, Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS. Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.

Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal - VPS.
Laboratório de Biologia Molecular e Sorologia Aplicadas.
Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo.

Publicado

22/12/2015

Edição

Seção

Preventive Veterinary Medicine/Medicina Veterinária Preventiva